79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3315 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  100 
 
 		 276 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  98.91 
 
 		 276 aa  523  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  70.67 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  66.32 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  70.04 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  66.55 
 
 		 271 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  68.1 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  67.88 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  51.13 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  48.19 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  39.85 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  41.03 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  40.36 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  36.84 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  39.07 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  36.9 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  39.07 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.74 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  40.52 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  43.48 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  39.7 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  34.72 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  38.89 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  34.8 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30.6 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  32.46 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  28.76 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  30.57 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42.71 
 
 		 115 aa  72  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.25 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.69 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.89 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  30.7 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.66 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.66 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  21.74 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  21.68 
 
 		 388 aa  52.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  23.58 
 
 		 244 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.77 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  29.07 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  26.57 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  23.67 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.69 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.77 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  46.55 
 
 		 104 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  24.31 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  24.91 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  21.4 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  24.77 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.51 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  23.94 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  23.67 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  24.31 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  21.4 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  24.69 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  49.12 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  25.27 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  24.69 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  49.12 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.24 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  23.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  23.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  23.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  23.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.26 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  30.09 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.7 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.32 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  23.27 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23.88 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  22.08 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.5 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  24.14 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.22 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  24.3 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>