46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0975 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  230  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  51.04 
 
 		 257 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  50 
 
 		 257 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  41.75 
 
 		 291 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  55.21 
 
 		 255 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  46.6 
 
 		 268 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  50 
 
 		 258 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  44.66 
 
 		 268 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  48.45 
 
 		 261 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  42.72 
 
 		 268 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  46.6 
 
 		 289 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  41.75 
 
 		 305 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  50 
 
 		 265 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  48.94 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  40 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  42 
 
 		 298 aa  74.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  42.71 
 
 		 277 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  42.71 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  42.71 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  50.7 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  42.71 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  38.54 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  41.35 
 
 		 271 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  36.27 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  32.63 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  32.29 
 
 		 231 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  40.58 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  34.78 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  38.71 
 
 		 260 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  34.83 
 
 		 246 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  34.38 
 
 		 262 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.74 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  30.39 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  26.74 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  36.76 
 
 		 304 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  34.33 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  31.82 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.17 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  35.38 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  29.7 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  33.33 
 
 		 273 aa  41.6  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.41 
 
 		 272 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 309 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.52 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.52 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>