51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48518 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  100 
 
 		 373 aa  761    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  52.45 
 
 		 242 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  52.45 
 
 		 244 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  53.06 
 
 		 246 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  53.06 
 
 		 231 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  45 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  40.71 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 289 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  40.71 
 
 		 257 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  33.81 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  33.58 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  31.16 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  35.96 
 
 		 268 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  38.4 
 
 		 258 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  35.09 
 
 		 268 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  33.58 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  36.84 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  35.61 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  34.45 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  26.67 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  34.03 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  29.35 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  36 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  24.55 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  30.82 
 
 		 260 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  30.94 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  29.53 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  29.53 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  31.62 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  38.84 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  38.84 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  32.63 
 
 		 115 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  30.72 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  30.7 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  27.54 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  30.7 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  29.82 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  27.21 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  24.82 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  29.06 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.51 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  30.47 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.69 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  28.35 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  23.97 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  26.9 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  40.35 
 
 		 104 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  28.1 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  28.1 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  30.07 
 
 		 278 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>