154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2621 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  100 
 
 		 291 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  92.36 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  74.16 
 
 		 268 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  73.41 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  72.83 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  50.78 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  61.66 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  57.75 
 
 		 289 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  62.1 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  46.18 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  42.25 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  44.4 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  44.57 
 
 		 263 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  46.96 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  39.93 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  38.03 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  35.35 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  40.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  39.85 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  36.86 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  39.13 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  39.05 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  37.26 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  38.92 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  32.32 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  35 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  34.34 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  27.87 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  41.75 
 
 		 115 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  33.58 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  34.18 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  26.24 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  29.11 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.52 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.92 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.55 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.8 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.55 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.89 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  24.02 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.21 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  24.89 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  29.33 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  35.8 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.58 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  28.28 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  27.7 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.28 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  23.77 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.28 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.28 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.28 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  25.94 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.57 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  22.79 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.78 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.36 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.4 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.55 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  28.57 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  28.57 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  23.11 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  26.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  25.54 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  27.6 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.54 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  22.71 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.71 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  28.19 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.69 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  23.87 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  24.46 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  25.2 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  25.2 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  25.96 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.04 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  21.3 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  24.57 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  29.53 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  29.53 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.17 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  27.97 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30.22 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  24.64 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  21.7 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.73 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  21.12 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  23.11 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  21.64 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.82 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  23.58 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>