153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3004 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  100 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  56.73 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  55.6 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  64.06 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  62 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  56.2 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  55.47 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  56.82 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  46.88 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  46.86 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  42.32 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  45.77 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  44.56 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  44.22 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  43.08 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  46.72 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  47.62 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  44.36 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  44.77 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  46.01 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  46.01 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  43.62 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  37.44 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  43.94 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  33.96 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  35.9 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  31.96 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  45.37 
 
 		 115 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  36.36 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  34.78 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  30.12 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  30.47 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  27.94 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  31.47 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  25.57 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  25.21 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.69 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.69 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.89 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  26.54 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  31.02 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  27.05 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  44.71 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  44.71 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  25 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  27.23 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  30.35 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  25.26 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  28 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  28.49 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.37 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.37 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  26.67 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  26.63 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.13 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.39 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  30.99 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  29.81 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  29.3 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  29.3 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  29.3 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  25.21 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  29.3 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  29.3 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  28.4 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  28.4 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  23.44 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30.63 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  25.25 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  27.07 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  22.91 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  30.17 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.36 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.67 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  30.46 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.23 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  28.47 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  22.38 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  24.24 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  23.36 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  27.18 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  26.57 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  22.43 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  25.52 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  29.33 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>