83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1529 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  100 
 
 
243 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  29.34 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  31.65 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  25.33 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  29.1 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  27.95 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  28.21 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.16 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  30.77 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  37.29 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  29.41 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  30.39 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  24.18 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  27.17 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  28.76 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  35.59 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.61 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.42 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  26.72 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  25.3 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  27.34 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  29.76 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  28.95 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  26.25 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  28.12 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  26.82 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  30.45 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30.21 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  29.07 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.65 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.27 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.19 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  25.86 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.64 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  26.11 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  22.73 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  25.82 
 
 
246 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  26.48 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  26.48 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1695  zinc/iron ABC transporter permease  27.23 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  33.91 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  22.92 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.59 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  30.47 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  28.39 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  23.66 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  28.7 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  29.03 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  23.11 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  27.52 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  26.18 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.24 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  22.91 
 
 
255 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  23.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  24.77 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  23.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  27.59 
 
 
300 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25.85 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  26.85 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  25 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  24.39 
 
 
309 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  22.54 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  25 
 
 
289 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  22.9 
 
 
244 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  28.04 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  24.47 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  27.41 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  26.09 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  24.89 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  33.81 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  26.76 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  27.59 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  24.41 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  25.32 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  27.13 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  25.64 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.88 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  25.54 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  25 
 
 
243 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  30.1 
 
 
373 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.52 
 
 
269 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>