94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4121 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  64.82 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  29.32 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  27.85 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  26.61 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.8 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.8 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  30.81 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  25.75 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.81 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.8 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  28 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  25.44 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  22.31 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  25.93 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  25.85 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  27.65 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  25.99 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  23.58 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  23.7 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  23.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  24.88 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  23.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  23.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  23.75 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  27.97 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  28.71 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  25 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.58 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  24.76 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  23.4 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  25.65 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.07 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  23.05 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.83 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  28.85 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  23.98 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  25 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  23.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  22.55 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  25.42 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  25.73 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  23.04 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  27.46 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  27.38 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  27.65 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  27.73 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  25.12 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  21.23 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.69 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  25.96 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  23.83 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  29.1 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  25.87 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  28.7 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.85 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  20.63 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  20.44 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  25.2 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  26.32 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  23.81 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.1 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  23.18 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  23.02 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  25.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  30.95 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  22.53 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  25.33 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  25.7 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  25.86 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  25.38 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  22.65 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  26.29 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  26.16 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  28.65 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  23.74 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  26.25 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  23.04 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  24.9 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  24.77 
 
 		 244 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>