89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2504 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  100 
 
 		 250 aa  474  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  61.45 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  59.84 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  64.11 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  59.84 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  53.01 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  54.94 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  59.35 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  58.78 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  48.95 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  46.31 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  44.66 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  41 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  37.93 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  37.93 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  37.93 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  38.82 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  40.91 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.91 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.87 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.87 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  38.87 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  35.47 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  31.7 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  58.9 
 
 		 96 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  30.84 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.35 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.81 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.02 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.02 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  30.8 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.4 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  27.68 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  28.76 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  26.02 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  24.43 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  32.41 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  31.19 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  30.39 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  28.51 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  32.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  32.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  32.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  32.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  32.14 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.51 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.8 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  25.6 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  29.41 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  31.38 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.41 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  28.95 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  28.96 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32.5 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32.5 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  27.46 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  24.79 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.53 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  24.8 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  23.63 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.5 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  27.98 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.96 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  29.88 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  24.22 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  24.3 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  26.73 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.5 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.48 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.77 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  23.91 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  25.47 
 
 		 317 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  29.46 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  24.88 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>