31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0129 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  100 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  47.09 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  44.5 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  43.06 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  45.63 
 
 		 252 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  44.66 
 
 		 250 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  46.6 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  40.29 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  42.16 
 
 		 250 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  40.78 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  40.69 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.18 
 
 		 425 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  41.18 
 
 		 425 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  34.78 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  29.76 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  29.35 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  33.55 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  33.55 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  33.55 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  34.53 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  36.15 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  32.88 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  32.88 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  32.88 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.93 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  46.38 
 
 		 96 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.94 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  28.78 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  27.15 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.23 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  31.58 
 
 		 255 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>