90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5177 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  100 
 
 		 243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  100 
 
 		 243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  99.59 
 
 		 243 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  35.27 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  37.17 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  38.31 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  38.87 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  37.79 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  35.1 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  40.57 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  41.44 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  38.8 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  37.97 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  38.93 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  40.57 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  37.9 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  33.55 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  37.22 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.62 
 
 		 425 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.62 
 
 		 425 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  26.46 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  31.84 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  28.7 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  26.51 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.92 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.92 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  33.62 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  32.24 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30.9 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  27.47 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  29.77 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.31 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.41 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.94 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  27.88 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  30.81 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.22 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  29.91 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  34 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  29.15 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.39 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.94 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.94 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  29.52 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  29.33 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.19 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  28.98 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.07 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  30.48 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  28.44 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.38 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.91 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.89 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.91 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.47 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  26.21 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  28.44 
 
 		 312 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  26.29 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  28.21 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  29.95 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  26.01 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  29 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  30.43 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  31.36 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  28.77 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  26.79 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  25.16 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.5 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  29.73 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  27.62 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.09 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  28.25 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.67 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.06 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.14 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  28.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  31.51 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  27.82 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  28 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  32.65 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  30.99 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  23.5 
 
 		 244 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>