44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4403 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  100 
 
 
232 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  35.47 
 
 
250 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  34.23 
 
 
251 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  36.32 
 
 
251 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  32.77 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  37.68 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  33.19 
 
 
252 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  33.64 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  33.64 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  33.64 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  34.32 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  29.35 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  28.45 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  38.93 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.93 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.93 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  31.84 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  31.65 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  32.03 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  30.9 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  28.93 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
425 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 
425 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  29.95 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  34.72 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  32.22 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  35.37 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  27.23 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  27.23 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  30.77 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  29.27 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  25.11 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  31.21 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  28.67 
 
 
271 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  33.88 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.62 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  27.88 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.09 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  27.32 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  26.7 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  31.9 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  26.75 
 
 
268 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  27.7 
 
 
306 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23.9 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>