58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4612 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  100 
 
 
234 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  100 
 
 
234 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  100 
 
 
234 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  55.92 
 
 
248 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  56.96 
 
 
240 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  37.87 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  41.43 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  36.09 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  38.4 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  39.58 
 
 
244 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  37.66 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  38.03 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  37.45 
 
 
251 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  38.27 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.27 
 
 
243 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.27 
 
 
243 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  37.66 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  34.33 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  34.89 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  33.93 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 
425 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 
425 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  27.35 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  32.88 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  27.31 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.41 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.63 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  23.36 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  27.76 
 
 
269 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  28.5 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.27 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  27.35 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  28.92 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  24.88 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  29.48 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  24.9 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  23.83 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.41 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  28.64 
 
 
238 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  28.38 
 
 
300 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  26 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  31.15 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  27.32 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  29.91 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  25.46 
 
 
279 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  28.51 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  27.15 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  26.22 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  29.46 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  28.31 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  29.02 
 
 
297 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  29.03 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  27.08 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  28.7 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.29 
 
 
271 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  27.19 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.13 
 
 
300 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  27.64 
 
 
265 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>