54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0755 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  66.96 
 
 		 237 aa  314  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  64.35 
 
 		 238 aa  297  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  58.9 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  53.22 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  51.06 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  55.75 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  46.78 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2067  hypothetical protein  43.88 
 
 		 114 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  30.84 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  26.94 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  30.17 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  34.15 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  21.67 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.43 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  27.4 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  23.12 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.74 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  21.52 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  26.15 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  27.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  27.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  27.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  28.45 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  27.82 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  26.94 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  23.58 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  25.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  26.32 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.43 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  23.72 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.64 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.88 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32.41 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32.41 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  31.78 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  29.89 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  29.46 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.99 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  22.22 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  31.75 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  25.89 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  32.56 
 
 		 317 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  27.48 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  24.6 
 
 		 276 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  33.96 
 
 		 286 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  28.68 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>