38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03733 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  53.65 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  53.45 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  54.59 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  51.57 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  51.5 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  45.15 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  47.84 
 
 		 238 aa  191  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2067  hypothetical protein  41.3 
 
 		 114 aa  72  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  31.82 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  30.6 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  30.43 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  29.29 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  28.11 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  29.95 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  27.98 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  29.96 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  29.44 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  23.18 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  32.28 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  26.48 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.05 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.08 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  31.58 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  32.74 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  31.4 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.09 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  31.34 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.69 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  28.19 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  20.96 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.89 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  25.12 
 
 		 389 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  30.58 
 
 		 305 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  26.24 
 
 		 258 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>