116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0652 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  58.89 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  53.01 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  51.6 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  50.4 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  55.42 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  52.4 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  50.81 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  50.6 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  46.09 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  45.68 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  40.29 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  40.17 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  40.33 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  36.09 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  36.09 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  36.09 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  35.1 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  35.1 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  34.69 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  33.63 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  28.45 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  26.97 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.81 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.81 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  31.06 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.79 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.79 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.02 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  27.4 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  28.21 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  27.73 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  27.39 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.82 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.1 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.24 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.29 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.91 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  27.12 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  30.86 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  25.4 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  25.7 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  22.54 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.1 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.25 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  27.83 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.78 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.62 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  27.63 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  23.87 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.56 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  23.57 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  29.85 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.61 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  27.52 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  28.5 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  24.08 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.58 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.09 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.53 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.38 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  47.22 
 
 		 96 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.59 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  25.46 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.07 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  25.74 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  30.61 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  30.61 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  29.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  29.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  29.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  29.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  29.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  31.2 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  22.92 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  25.1 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.04 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  26.82 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  23.57 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  25.93 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  23.32 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  25 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  26.72 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  26.22 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>