80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5719 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  100 
 
 		 252 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  65.33 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  58.89 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  57.94 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  55.69 
 
 		 251 aa  258  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  60.16 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  54.94 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  58.02 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  54.03 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  53.23 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  45.63 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  47.37 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  41.15 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  43.1 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.03 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.03 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.03 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  34.07 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.43 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.31 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.31 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  37.9 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  33.19 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.98 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  59.72 
 
 		 96 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.13 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.73 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  29.67 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  27.43 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.5 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  28.07 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  30.56 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  27.19 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  30.27 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  27.8 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  25.71 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  28.82 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.31 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  30.09 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.31 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.33 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  30.47 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  29.44 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  22.39 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  28.78 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  26.03 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.85 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  26.91 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  28.91 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  28.12 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  26.89 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.31 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  25.55 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  25.52 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  25 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  30.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.11 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  29.46 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  22.52 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.22 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.56 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.17 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  29.24 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  29.24 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  26.83 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0543  zinc/iron permease  23.49 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.884027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.32 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.97 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  27.43 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.63 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.33 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  30.97 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 258 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>