101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1873 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  64.82 
 
 
259 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  29.63 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  28.08 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.68 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  25.97 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.32 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  25 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.34 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  23.98 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  25.97 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  28.12 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.58 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.53 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  27.04 
 
 
389 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  24.58 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  24.66 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  27.43 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  25.71 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.05 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.05 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  24.62 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  30.26 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.71 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  23.85 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  26.97 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  26.43 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  23.94 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  25.56 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  22.84 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  26.02 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  25.09 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  29.15 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  23.5 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  23.5 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  23.5 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  23.5 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  23.5 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  23.33 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.67 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  24.62 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  27.82 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  27.02 
 
 
249 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  23.83 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  25.49 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  22.46 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.4 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  24.68 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  23.33 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.83 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.94 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.91 
 
 
298 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.06 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  25.1 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  24.58 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  27.5 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.43 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  24.25 
 
 
289 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  25.08 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  24.02 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  26.61 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  26.61 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  26.61 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  24.36 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  29.69 
 
 
390 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  23.55 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  22.13 
 
 
271 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.31 
 
 
269 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  29.57 
 
 
188 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  23.17 
 
 
272 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  24.69 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  25.93 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.09 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  23.91 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  22.94 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  23.69 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  22.78 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  22.88 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  26.84 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  23.53 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  24.15 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  29.2 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.98 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  28.27 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  22.32 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  25.1 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.01 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  21.9 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  26.29 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  23.43 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  21.66 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  23.36 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>