67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1307 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  100 
 
 
245 aa  486  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  42.21 
 
 
389 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  36.95 
 
 
244 aa  158  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  37.16 
 
 
220 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  26.67 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  27.56 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  30.04 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  26.67 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.27 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.52 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  33.05 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  27.23 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.37 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  27.94 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  26.24 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.32 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.46 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.46 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  22.07 
 
 
251 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.11 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  27.27 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.39 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.39 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.39 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.39 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  24.31 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  26.39 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  28 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  29.6 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.89 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  26.83 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  28.8 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  27.71 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  28.94 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
257 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.55 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  28.48 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  22.73 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.97 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  25.11 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  27.27 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  23.42 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  29.34 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  25.89 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  30.21 
 
 
239 aa  45.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  26 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  24.76 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  25.46 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  27.02 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  26.92 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  26.32 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  27.93 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  27.93 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  27.93 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  25.65 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  25.65 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  23.63 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  27.23 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  24.27 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>