50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2515 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  457  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  96.46 
 
 
242 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  45.11 
 
 
237 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  44.68 
 
 
237 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  44.13 
 
 
249 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  44.83 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  46.32 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  43.06 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  41.67 
 
 
241 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  41.67 
 
 
241 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  40.83 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  37.89 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  46.34 
 
 
214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  46.26 
 
 
244 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  40.44 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  44.39 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  43.17 
 
 
228 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  36.17 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  26.89 
 
 
389 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  27.16 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.4 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  29.13 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  27.52 
 
 
317 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.34 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.04 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.64 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.88 
 
 
304 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  27.93 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  24.4 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.57 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  28.83 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  29.77 
 
 
244 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  27.98 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.31 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  27.01 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  27.57 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  27.01 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.08 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.64 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.34 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.64 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  26.5 
 
 
309 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  25.73 
 
 
309 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  28.63 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  24.5 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.12 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  34.23 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  27.27 
 
 
312 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  23.95 
 
 
308 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>