30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3687 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  98.34 
 
 		 241 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  94.61 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  95.85 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  40.41 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  43.86 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  40.62 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  40.18 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  44.25 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  43.81 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  49.75 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  40.09 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  39.83 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  43.41 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  36.86 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  30.3 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  28.39 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  24.88 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.43 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  26.13 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.79 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.46 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  27.21 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  27.89 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  27.21 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.76 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>