39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4074 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  100 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  71.03 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  60 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  45.83 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  48.08 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  43.93 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  47.11 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  43.93 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  48.56 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  48.56 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  48.56 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  45.61 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  49.48 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  42.53 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  37.72 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  37.28 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  36.8 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  38.12 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  30.08 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  25.78 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  29.85 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  29.85 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  25.74 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.89 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.77 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  31.43 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  30.94 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.44 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.47 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  25.29 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  29.41 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  25.32 
 
 		 389 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  27.48 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.41 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.31 
 
 		 309 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  26.01 
 
 		 309 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  26.15 
 
 		 261 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>