45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7280 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  100 
 
 		 230 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  57.94 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  60 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  43.93 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  46.72 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  45.24 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  41.13 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  40.69 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  41.88 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  41.88 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  43.72 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  44.81 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  43.26 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  41.59 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  39.73 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  37.1 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  37.23 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  38.57 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  29 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  26.58 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  21.82 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  29.75 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.36 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28.37 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  29.86 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  28.37 
 
 		 312 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  27.66 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  27.96 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.13 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  24.42 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  21.79 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  27.23 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  23.46 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 389 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  28.05 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  23.46 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  29.66 
 
 		 317 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  25.23 
 
 		 220 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 304 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>