26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3835 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  98.34 
 
 		 241 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  98.34 
 
 		 241 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  92.95 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  94.19 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  40 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  43.42 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  41.74 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  41.28 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  44.69 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  44.25 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  41.33 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  40.18 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  49.75 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  40.09 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  40.25 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  43.9 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  36.44 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  27.74 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.85 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.56 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.79 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  24.88 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>