29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2839 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  100 
 
 		 240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  40.83 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  43.6 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  46.72 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  41.71 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  43.4 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  43.4 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  41.67 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  41.67 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  45.16 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  42.93 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  45.16 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  41.26 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  39.45 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  40.35 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  34.65 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  44.54 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  31.14 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  20.52 
 
 		 389 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  26.05 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  25.51 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  26.23 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.34 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  23.81 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  29.63 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  25.33 
 
 		 244 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.44 
 
 		 309 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>