44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2368 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  458  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  96.46 
 
 		 242 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  44.68 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  44.26 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  42.4 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  45.26 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  46.32 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  43.54 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  47.09 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  42.5 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  42.5 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  38.33 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  45.81 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  41.33 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  44.64 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  42.53 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  37.71 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  26.81 
 
 		 389 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.4 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  27.03 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  29.57 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  26.58 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  27.52 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  25.98 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  29.28 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.88 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  28.04 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  27.48 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  23.44 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.19 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  34.48 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  26.27 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.34 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  26.92 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.12 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.31 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.87 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  27.38 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.08 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  27.98 
 
 		 264 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.45 
 
 		 272 aa  42  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>