24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0428 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  56.22 
 
 		 389 aa  242  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  37.9 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  39.05 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  31.72 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  30.14 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  26.87 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  27.01 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.39 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  26.54 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  24.26 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  27.49 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  27.48 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  33.04 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.71 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  26.47 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.81 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  26.83 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  29.41 
 
 		 271 aa  42  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.1 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  29.29 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  28.97 
 
 		 243 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.22 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>