28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2423 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  92.95 
 
 
241 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  95.85 
 
 
241 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  95.85 
 
 
241 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  94.19 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  40 
 
 
249 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  43.17 
 
 
240 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  45.24 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  40.62 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  40.18 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  42.48 
 
 
244 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  41.33 
 
 
242 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  40.89 
 
 
242 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  39.19 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  48.53 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  44.17 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  38.56 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  36.02 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  27.68 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.23 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  25.36 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  28.57 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  27.1 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  25.68 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  27.21 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  27.21 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  27.21 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  27.21 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>