45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7423 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  71.84 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  59.31 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  48.21 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  44.7 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  47.09 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  43.38 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  40 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  46.34 
 
 		 242 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  42.01 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  43.13 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  43.13 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  43.52 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  40.36 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  39.91 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  42.78 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  33.78 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  31.65 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.43 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.09 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32.12 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32.12 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  27.1 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  29.13 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  26.82 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  26.21 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  29.5 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  27.34 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  28.63 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30.82 
 
 		 300 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.97 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  28.03 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  27.21 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28.23 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  30.99 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25.23 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 259 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.48 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 312 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 312 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>