61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0065 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  80.08 
 
 		 237 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  64.35 
 
 		 236 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  59.75 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  56.77 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  52.91 
 
 		 238 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  52.4 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  48.93 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2067  hypothetical protein  48.45 
 
 		 114 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.3 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  29.1 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  29.86 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  26.44 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  26.61 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.61 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  23.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  27.63 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  23.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  23.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.88 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.11 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  24.68 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  22.98 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  28 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  28.68 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  29.86 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  23.29 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  27.03 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  24.36 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  28.21 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  32.69 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  23.92 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.74 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.53 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.72 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  30.92 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  23.24 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  27.86 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  25.76 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.83 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  26.7 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  26.82 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  25.63 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  26.11 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  25.44 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  28.68 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  29.46 
 
 		 239 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  24.22 
 
 		 272 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>