76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1907 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  51.05 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  51.05 
 
 		 237 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  48.93 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  46.78 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  48.92 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  47.84 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  44.44 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  28.4 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2067  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  34.75 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  29.95 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  29.18 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  28.1 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  28.84 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  27.73 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  26.95 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  28.38 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  28.38 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  28.38 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  27.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  26.29 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.23 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.78 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  26.12 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  25.44 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.37 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  27 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  27.34 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  27.34 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  26.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  25.88 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  29.74 
 
 		 306 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  26.51 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  27.48 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  31.71 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  27.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  27.81 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  22.01 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  35.16 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  32.56 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  25.68 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  27 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  25.23 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  26.1 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  29.38 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  32.48 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  30.33 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  26.77 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  24.59 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  27.03 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.67 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  24.8 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  26.43 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  24.46 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  26.8 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  24.04 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  25.37 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  25.81 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.71 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  25.11 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  29.71 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  27.93 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  26.03 
 
 		 270 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  32.14 
 
 		 255 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  30.3 
 
 		 267 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>