90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3027 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  100 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  64.8 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  59.84 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  56.22 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  58.63 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  55.42 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  61.69 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  57.89 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  57.72 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  54.2 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  47.09 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  48.36 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  40.69 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  40.69 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  40.69 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  42.68 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  39.83 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  46.67 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.67 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  34.36 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  36.32 
 
 		 232 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  68.57 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  26.77 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  28.99 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  26.61 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  29.96 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  29.03 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.46 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  28.45 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.89 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  27.12 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  27.15 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  26.86 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  27.59 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  29.73 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  24.91 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  29.47 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.12 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.07 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  26.54 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  27.65 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  28.29 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.64 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  29.27 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  25.41 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  27.41 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  27.48 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  24.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.04 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  29.27 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  25.85 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25.3 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.7 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25.82 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  26.98 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.5 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  27.65 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.48 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  28.03 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  25.6 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  26.05 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.76 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  27.23 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  31.29 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  27.92 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  28.37 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  27.41 
 
 		 297 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 304 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  29.18 
 
 		 262 aa  42  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.35 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.35 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.35 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.35 
 
 		 257 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  30.2 
 
 		 276 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  25.94 
 
 		 309 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>