66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2949 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  100 
 
 
245 aa  473  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  59.39 
 
 
237 aa  272  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  57.64 
 
 
237 aa  269  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  55.75 
 
 
236 aa  254  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  56.77 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  52.21 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  51.32 
 
 
247 aa  224  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  48.92 
 
 
238 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2067  hypothetical protein  46.3 
 
 
114 aa  85.5  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  31.38 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.11 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  27.27 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  28.7 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.73 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  24.44 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  34.19 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  34.19 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  27.1 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  28.71 
 
 
244 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  31.39 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.81 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.91 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.91 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  31.79 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  24.59 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  29.5 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  33.93 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  27.2 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  28.46 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  29.12 
 
 
302 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  27.23 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.19 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  27.35 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  24.14 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.27 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.02 
 
 
271 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  29.58 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  27.35 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  27.63 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  28.7 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  32.79 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.97 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  27.43 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  27.83 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25.55 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  25.2 
 
 
389 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  29.73 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.45 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.4 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  28.08 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  28.5 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  34.91 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  26.07 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  28.7 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  29.15 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  30 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  26.96 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  29.02 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  31.86 
 
 
235 aa  42  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  26.32 
 
 
300 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  31.06 
 
 
285 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  24.35 
 
 
272 aa  42  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>