88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0769 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  100 
 
 		 228 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  38.5 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  36.73 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  34.36 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  36.04 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  34.07 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  33.63 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  35.14 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  31.7 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  29.76 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  34.25 
 
 		 250 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  33.33 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  31.44 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  31.44 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.24 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.24 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  28.37 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  28.37 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  28.37 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  27.67 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.37 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.57 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  26.46 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  26.46 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  26.46 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.31 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.91 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  28.16 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  26.83 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  28.37 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  26.8 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  26.24 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.61 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  26.64 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  29.68 
 
 		 309 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  23.5 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.96 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  25.11 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  23.3 
 
 		 389 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  24.77 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  25.59 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  23.88 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  22.52 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  23.95 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  33.59 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  23.42 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  26.8 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  25 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  24.06 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  27.14 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  22.75 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  23.63 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  22.17 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  28.49 
 
 		 312 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  25 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.24 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.24 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  24.68 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  23.91 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  25.33 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  20.39 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  30 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  24.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  27.45 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.2 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  33.33 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  29.11 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  23.43 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  27.54 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  23.63 
 
 		 271 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>