71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2825 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  100 
 
 		 244 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  55.5 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  53.23 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  49.59 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  51.22 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  46.09 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  48.95 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  49 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  52.87 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  47.5 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.96 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.96 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.96 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  40.78 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  39.51 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  43.57 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  41.3 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  36.04 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  40.57 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  40.57 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  40.57 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  45.32 
 
 		 425 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.32 
 
 		 425 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  37.28 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.23 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  33.58 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  27.69 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.98 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.82 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  21.66 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  27.86 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  25.26 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  29.73 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  49.28 
 
 		 96 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.85 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  28 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  26.61 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.84 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.9 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  25.87 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  28.94 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.76 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.76 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  28.97 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  28.89 
 
 		 309 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  24.9 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  24.89 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  27.04 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.27 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  30.94 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  29.15 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  32.88 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  26.72 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  29.15 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  23.68 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.21 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.27 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  24.39 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  29.73 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  23.81 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  27.27 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.2 
 
 		 251 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  25.63 
 
 		 265 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  25.49 
 
 		 270 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>