15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4794 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  68.57 
 
 		 251 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  58.9 
 
 		 250 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  61.43 
 
 		 251 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  61.43 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  61.43 
 
 		 252 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  59.72 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  54.17 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  46.38 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  40.58 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  41.79 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.79 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  47.22 
 
 		 249 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  50.75 
 
 		 244 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  54.93 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>