95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3407 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  100 
 
 		 251 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  84.86 
 
 		 251 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  59.84 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  57.94 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  63.2 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  58.63 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  61.2 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  50.4 
 
 		 249 aa  244  8e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  55.28 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  51.22 
 
 		 244 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  45.71 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  43.06 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.4 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.4 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.4 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  36.73 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  36.89 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  38.03 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  34.62 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  30.74 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  61.43 
 
 		 96 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  26.61 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.63 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  25.1 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.44 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.35 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  23.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  26.32 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.8 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  25.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  25.62 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  23.04 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  30.91 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  28.94 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.45 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  25.93 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  26.98 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  26.05 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.33 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.78 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.2 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  28.19 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  23.68 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  25.11 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  24.24 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.95 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  23.9 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1907  divalent heavy-metal cations transporter  28.57 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00586465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  27.34 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  26 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.87 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  26.62 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  26.61 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  23.27 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  26.24 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  27.17 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2949  zinc/iron permease  31.25 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.11 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  26.75 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  29.02 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  22.49 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.03 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  22.05 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  24.45 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  24.22 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  21.74 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  24.81 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  27.89 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.56 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.91 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  23.79 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.8 
 
 		 309 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  25.68 
 
 		 269 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>