20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1851 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  35.56 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1372  hypothetical protein  33.48 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2493  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0247197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08551  hypothetical protein  39.22 
 
 
223 aa  121  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0375  hypothetical protein  35.07 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1199  zinc/iron permease  33.06 
 
 
232 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.29 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  26.83 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0472  ZIP family zinc transporter  29.74 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  25.75 
 
 
278 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1695  zinc/iron ABC transporter permease  29.74 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  26.49 
 
 
251 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  26.07 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42412  predicted protein  25.73 
 
 
303 aa  45.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2013  hypothetical protein  26.17 
 
 
252 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.98 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2018  hypothetical protein  26.17 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0543  zinc/iron permease  23.5 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.884027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  25 
 
 
243 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>