19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1409 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2493  hypothetical protein  42.92 
 
 
222 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0247197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0375  hypothetical protein  40.25 
 
 
245 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08551  hypothetical protein  43.46 
 
 
223 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1199  zinc/iron permease  39.83 
 
 
232 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1372  hypothetical protein  36.07 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  35.56 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  23.39 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2013  hypothetical protein  28.44 
 
 
252 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2018  hypothetical protein  27.19 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  24.26 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46780  predicted protein  24.07 
 
 
436 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.57 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  23.65 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  22.27 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  24.71 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42412  predicted protein  22.73 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0543  zinc/iron permease  24.35 
 
 
240 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.884027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  23.84 
 
 
246 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>