14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46780 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46780  predicted protein  100 
 
 
436 aa  889    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27890  ZIP family transporter: zinc ion  28.89 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0472  ZIP family zinc transporter  27.21 
 
 
261 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1695  zinc/iron ABC transporter permease  27.21 
 
 
261 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2018  hypothetical protein  22.73 
 
 
252 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2013  hypothetical protein  22.73 
 
 
252 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  24.15 
 
 
278 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  25 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00350  low-affinity zinc ion transporter, putative  24.36 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292385  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03799  Low-affinity zinc transporter of the plasma membrane, putative (Eurofung)  22.53 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.207161  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  24.79 
 
 
272 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  23.33 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01833  ZIP Zinc transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09560)  24.24 
 
 
458 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.393178  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  25.15 
 
 
267 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>