18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1199 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1199  zinc/iron permease  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2493  hypothetical protein  53.71 
 
 
222 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0247197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08551  hypothetical protein  52.17 
 
 
223 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  40.69 
 
 
244 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  34.54 
 
 
243 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0375  hypothetical protein  34.43 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1372  hypothetical protein  37.39 
 
 
250 aa  109  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  25.71 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  21.72 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2013  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2018  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25.82 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  22.04 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  27.93 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  27.93 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46780  predicted protein  24.43 
 
 
436 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  27.93 
 
 
289 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>