66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3935 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  100 
 
 
288 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  95.53 
 
 
291 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  91.35 
 
 
289 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  69.79 
 
 
278 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  31.62 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  29.62 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3478  zinc/iron permease  35.58 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  33.06 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  27.95 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  27.31 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  28.57 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  25.11 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  25.39 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  28.84 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  26.96 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  26.74 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  30.16 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  26.58 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  29.37 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2013  hypothetical protein  25.38 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  30 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2018  hypothetical protein  25.79 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  31.67 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  29.37 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  31.67 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  29.17 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06216  ZIP metal ion transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12050)  35.65 
 
 
386 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.369537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  28.44 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  29.96 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  28.8 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.37 
 
 
247 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42412  predicted protein  31.67 
 
 
303 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.37 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  26.79 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  27.94 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  23.49 
 
 
373 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46780  predicted protein  23.98 
 
 
436 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.55 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  26.35 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  26.35 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  25.1 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  29.93 
 
 
232 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  25.3 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0375  hypothetical protein  27.46 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  26.44 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  24.59 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  22.91 
 
 
247 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08551  hypothetical protein  29.2 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  24.89 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  24.11 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25.36 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  24.8 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  24.62 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  23.19 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  25.78 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  23.49 
 
 
391 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  23.04 
 
 
390 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.27 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  26.24 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  25.98 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1199  zinc/iron permease  28.3 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  22.4 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0472  ZIP family zinc transporter  26.38 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  28.78 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.77 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1695  zinc/iron ABC transporter permease  26.38 
 
 
261 aa  42  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>