16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3478 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3478  zinc/iron permease  100 
 
 		 411 aa  806    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  36.31 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  36.81 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  36.2 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  35.58 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  58.54 
 
 		 205 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  31.72 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06216  ZIP metal ion transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12050)  35.25 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.369537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  33.78 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  24.02 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  28 
 
 		 305 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42412  predicted protein  23.53 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  33.1 
 
 		 268 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>