15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42412 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42412  predicted protein  100 
 
 
303 aa  593  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06216  ZIP metal ion transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12050)  31.12 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.369537  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03190  hypothetical protein  34.5 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0685495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  27.43 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  31.67 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  31.67 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  31.67 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3478  zinc/iron permease  23.53 
 
 
411 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1851  zinc/iron permease  25.73 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  25.42 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  30.17 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  35.09 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  24.29 
 
 
477 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  24.29 
 
 
477 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  22.73 
 
 
244 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>