152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1978 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  65 
 
 
258 aa  330  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  62.6 
 
 
255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  56.65 
 
 
261 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  46.91 
 
 
229 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  43.02 
 
 
305 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  45.53 
 
 
257 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  41.86 
 
 
291 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  44.36 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  41.79 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  39.92 
 
 
251 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.23 
 
 
263 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  42.08 
 
 
268 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  42.08 
 
 
268 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  42.75 
 
 
289 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  35.61 
 
 
271 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  35.31 
 
 
298 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  33.57 
 
 
316 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  33.96 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  34.96 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  30.8 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30.98 
 
 
246 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  33.33 
 
 
242 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  34.67 
 
 
276 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  30.12 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  32.6 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  32.54 
 
 
244 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  36.81 
 
 
301 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  50 
 
 
115 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  31.08 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  35.61 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  29.34 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.23 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  47.78 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.38 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.51 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.77 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  22.87 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  25.1 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.81 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  31.97 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  38.46 
 
 
388 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  23.38 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.97 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.64 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25.64 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.85 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  35.71 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  29.59 
 
 
336 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  29.59 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  29.18 
 
 
472 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  24.84 
 
 
424 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.79 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  28.86 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.29 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  31.19 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.13 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  25 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  23.95 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  26.09 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  26.99 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  26.99 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  23.04 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  25.45 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.35 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  23.67 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  25.71 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  31.3 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  22.69 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  29.36 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.15 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  24.7 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.7 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  23.05 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  27.83 
 
 
477 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  27.83 
 
 
477 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.43 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  25.32 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  23.47 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  29.81 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  27.23 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  22.83 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.94 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  31.36 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  23.79 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.95 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  29.36 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  29.36 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  23.72 
 
 
271 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  21.55 
 
 
267 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.71 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  22.01 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  26.27 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  23.94 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  29.41 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  22.22 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  23.36 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  30.77 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>