41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42755 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  100 
 
 
391 aa  790    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  42.54 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  42.54 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  43.4 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  45.45 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  39.86 
 
 
261 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  36.36 
 
 
251 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  37.14 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  34.81 
 
 
291 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  25.72 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  36.57 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  37.98 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  37.98 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  31.9 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  36.59 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  40.98 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  38.26 
 
 
263 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  35.25 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  33.56 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  36.96 
 
 
242 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  31.69 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  31.97 
 
 
265 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  35.83 
 
 
268 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  34.27 
 
 
231 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  24.03 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  28.21 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  33.91 
 
 
243 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  27.33 
 
 
276 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  26.95 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  42.67 
 
 
335 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  42.67 
 
 
336 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  30.07 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  26.67 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  32.41 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  25.15 
 
 
301 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  23.49 
 
 
388 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  29.93 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  30.56 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  26 
 
 
262 aa  43.9  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  25.82 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>