264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15221 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  84.71 
 
 
515 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  85.37 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  65.95 
 
 
506 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  67.47 
 
 
513 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  65.87 
 
 
516 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  65.13 
 
 
387 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  35.96 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  29.06 
 
 
305 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  29.56 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.27 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28 
 
 
346 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 
354 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 
326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  33.15 
 
 
371 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 
317 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  37.04 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  29.61 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  30.46 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.81 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 
325 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.52 
 
 
344 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 
319 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 
327 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 
309 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
494 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  23.37 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  23.66 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  23.3 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  26.44 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.3 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
309 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  24.5 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.87 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.03 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  23.44 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.32 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.56 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.16 
 
 
308 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.47 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.6 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  22.17 
 
 
300 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  22.29 
 
 
309 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  28.12 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  23.46 
 
 
325 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0845  periplasmic solute binding family protein  27.81 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  22.16 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  23.74 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  23.87 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
571 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  23.89 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  25.97 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.56 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.56 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  21.69 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.34 
 
 
347 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.13 
 
 
285 aa  59.7  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.56 
 
 
311 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  21.47 
 
 
301 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 
294 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  24.63 
 
 
292 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  20.45 
 
 
292 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 
302 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  24.44 
 
 
287 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.89 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>