More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0801 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  99.63 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0433  periplasmic solute binding protein  40.38 
 
 		 259 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  33.8 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  31.11 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.46 
 
 		 322 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 		 339 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.73 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  28.24 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 		 328 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  30.11 
 
 		 303 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.59 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 315 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.4 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.44 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.1 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 306 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  23.78 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.19 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.47 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.02 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  24.76 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  27.23 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  25.89 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.13 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  27.99 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.59 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.95 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  24.74 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  24.39 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.74 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.72 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  28.19 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  29.24 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.44 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  24.36 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  24.54 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.72 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.72 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  27.31 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.72 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.72 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.74 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.83 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.08 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  26.44 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  23.93 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.78 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.99 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  25.35 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  25.35 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  25.74 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>