More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1329 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  98.17 
 
 		 328 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  100 
 
 		 352 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  98.71 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  98.39 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  98.39 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  98.39 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  98.39 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  98.06 
 
 		 310 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  97.42 
 
 		 310 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  86.31 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  86.31 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  86.31 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  86.31 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  86.31 
 
 		 314 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  82.17 
 
 		 314 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  64.56 
 
 		 321 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.87 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.87 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  59.01 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  59.01 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  55.21 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  56.54 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  39.54 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  44.29 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  42.41 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  41.97 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  39.69 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  38.82 
 
 		 307 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  41.67 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  37.87 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 297 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  38.91 
 
 		 313 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  39.8 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  34.78 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  37.19 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.77 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.77 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  37.31 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  38.06 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  36.56 
 
 		 318 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  38 
 
 		 302 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  37.67 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  36.03 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.35 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  44.63 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  30.41 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  33.02 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  40.61 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  34.73 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.79 
 
 		 282 aa  133  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  27.18 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  28.75 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  38.07 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 287 aa  123  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  29.55 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.34 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25.9 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.32 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.32 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.9 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.96 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.96 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.32 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.27 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.26 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.69 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  25.23 
 
 		 310 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 292 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  23.86 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 302 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  24.42 
 
 		 295 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  26.97 
 
 		 265 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.31 
 
 		 291 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.23 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.56 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>