More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1020 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  80.05 
 
 
432 aa  643    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  100 
 
 
423 aa  853    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  34.45 
 
 
407 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.33 
 
 
464 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.72 
 
 
538 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.1 
 
 
463 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.99 
 
 
518 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.11 
 
 
488 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.17 
 
 
522 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.92 
 
 
462 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.23 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.41 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.12 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.12 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.07 
 
 
480 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.78 
 
 
478 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.04 
 
 
460 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.98 
 
 
462 aa  146  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.88 
 
 
461 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.93 
 
 
472 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  27.64 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.98 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  27.75 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.11 
 
 
463 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 
464 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.76 
 
 
487 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.38 
 
 
494 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.88 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.65 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.17 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  27.18 
 
 
438 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.54 
 
 
472 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.4 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.48 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  28.53 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.58 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0798  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.98637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.2 
 
 
466 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.3 
 
 
428 aa  124  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  27.47 
 
 
466 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.24 
 
 
497 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.77 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.57 
 
 
497 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  26.47 
 
 
452 aa  120  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.42 
 
 
497 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  24.77 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.19 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.78 
 
 
562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.92 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3720  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.27 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.667765  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.19 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.13 
 
 
472 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.8 
 
 
461 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  26.04 
 
 
489 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  26.04 
 
 
489 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  26.04 
 
 
489 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  26.04 
 
 
489 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  26.04 
 
 
489 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 
449 aa  103  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  28.21 
 
 
493 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.87 
 
 
494 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
495 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.76 
 
 
436 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
495 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 
405 aa  100  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  26.86 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  26.86 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.07 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  28.01 
 
 
495 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  26.1 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  26.86 
 
 
465 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.39 
 
 
464 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.43 
 
 
480 aa  97.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.99 
 
 
477 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  25 
 
 
494 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.08 
 
 
574 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.67 
 
 
462 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.63 
 
 
475 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  25.87 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  26.05 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.12 
 
 
484 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  22.48 
 
 
574 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  25.87 
 
 
435 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  22.09 
 
 
442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  25.8 
 
 
435 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  26.09 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.45 
 
 
446 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.38 
 
 
501 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  27.52 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.83 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  27.27 
 
 
470 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.14 
 
 
456 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.3 
 
 
460 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.92 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>