More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2727 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 464 aa  905    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  54.83 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  54.95 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  55.75 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  49.04 
 
 		 456 aa  362  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.04 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.23 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.6 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.62 
 
 		 538 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.56 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.03 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.18 
 
 		 463 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.96 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.72 
 
 		 522 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.62 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  33.95 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.62 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.04 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.95 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  34.56 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.59 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.55 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.5 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.73 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.12 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.79 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.79 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.41 
 
 		 488 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.64 
 
 		 483 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.27 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.01 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  33.33 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.03 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.82 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.56 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.65 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  32.47 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  32.6 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  32.45 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.96 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.07 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.49 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.85 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.41 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.94 
 
 		 562 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.26 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.61 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  28.72 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.05 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.4 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  26.46 
 
 		 445 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.12 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  28.57 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.04 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.76 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.27 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  26.18 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.66 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.84 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 431 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.97 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.18 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.07 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.53 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.76 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.82 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.52 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 475 aa  97.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.56 
 
 		 462 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.41 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.93 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.7 
 
 		 524 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.71 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  24.23 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.96 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.83 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.21 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.83 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.4 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.83 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.71 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.38 
 
 		 450 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.61 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  26.5 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.89 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.79 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.63 
 
 		 609 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.3 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.72 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.72 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  26.85 
 
 		 407 aa  91.7  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  26.05 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.23 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.24 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>